对电子烟在日本的迅速普及，日本呼吸器官学会、日本禁烟协会等专业机构纷纷发表声明，指出电子烟对人体危害的隐蔽性，批评因政府不加限制，日本已经成为电子烟的试验场。
日本呼吸器官学会在发表的《日本呼吸器官学会对非燃烧、加热式香烟和电子烟的见解》中指出：使用非燃烧、加热式香烟和电子烟同样会给健康带来不利影响；使用非燃烧、加热式香烟和电子烟的人呼出的气溶胶会向四周扩散，将产生因被动吸烟而损害健康的可能，包括所有餐厅和酒吧在内的公共场所、公共交通设施等应禁止电子烟。
见解指出，获取新型香烟与疾病和死亡风险关联性的科学依据还需要很长时间，尽管现阶段相关机理还不明确，但有报告显示非燃烧、加热式电子烟不仅与传统香烟含有相同含量的尼古丁和挥发性化合物甲醛、丙烯醛，多环芳香族碳氢化合物的含量更是普通香烟的3倍。见解称，由于存在“与传统燃烧式香烟相比健康危害小”“没有被动吸烟的危险”“不产生烟雾或者烟雾看不见，所以可以在禁烟区域吸食”等误解，电子烟迅速得到普及。对此，学会对电子烟对民众健康及社会的影响表示担忧。
日本禁烟学会在早先发表的《紧急警告！！“加热式电子烟”与普通香烟一样危险》的声明中指出，加热式电子烟产生的蒸气不是水蒸汽，是以丙烯二醇等为主要成分的蒸气。《紧急警告》援引瑞士学者发表在美国医师会的文章指出，日本市面上的某款电子烟中甲醛等致癌物以及丙烯醛、苯甲醛等毒性物质和刺激性物质的含量，基本与传统香烟一样。虽然电子香烟看起来尼古丁含量较少，但这反而会引起吸烟者的补偿性吸烟行为，也就是无论尼古丁含量高低，吸烟者都会在血压内尼古丁浓度达到一定量后才会停止吸烟，因此，电子烟与普通香烟一样会对人体健康造成危害。
